Ruminant ve kanatlı hayvan kan serumlarında, hastalıkların teşhisi ve aşılama sonrası kontrol amacıyla serolojik testler yapılmaktadır. Genel olarak antikor-antijen ELISA ve aglütinasyon testleri, güvenilir test kitleri kullanılarak uygulanmaktadır. Test sonuçları, hayvanların yaşı, aşı geçmişi, fizyolojik durumu ve klinik bulgular gibi birçok parametre göz önüne alınarak değerlendirilir.

Ruminant ve kanatlı hayvanların viral hastalıklarının teşhisi için PCR/RT-PCR, Real-time PCR yöntemleri kullanılmaktadır. Ayrıca viral ve bakteriyel etkenlerin identifikasyonu, tiplendirmesi, aşı ve saha suşlarının ayrılması için PCR ve sekans analizi yöntemlerinden yararlanılmaktadır.

Ruminant ve kanatlılarda, ölü hayvanlardan yapılan otopsi sonucunda veya gönderilen iç organ numunelerinde, makroskobik bulgular değerlendirilerek raporlanır. Şüphelenilen hastalık/lar yönünden gerekli numuneler alınarak uygun yöntemleri ile test edilir.

Kan parazitlerinin teşhisi amacıyla kan ve iç organlardan hazırlanan sürme preparatlardan Giemsa boyama yapılarak direkt mikroskobik inceleme yapılır. Dışkı örneklerinde paraziter inceleme için flotasyon yöntemi uygulanır.